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 在育苗基質中，微生物不僅參與植物的生長與代謝，還參與基質中各種物質的轉化過程，并能降低有害物質含量，維持基質適宜的理化性狀。同時，微生物又是基質中物質間生理生化過程的主要調節者。基質微生物種群中，細菌數量zui多，可分解動植物殘體，進行固氮，為植物提供氮素營養，穩定根系微生態環境。

微生物菌劑，由一種或多種有益微生物、培養基和添加劑配制而成，其中所含微生物的生命活動，能增加基質栽培蔬菜作物養分的供應量，促進生長，提高作物抗病性，改善農產品品質及農業生態環境。

微生物菌劑形成的菌根能夠提高植物對根際礦質元素的吸收，改善植物的營養狀況，促進作物生長。基質中添加微生物菌劑后，一些有益微生物可改善基質物理性狀，提高基質酶活性，增加微生物數量和腐殖質含量，從而提高基質肥力水平。微生物菌劑能夠誘導或激活有益微生物在植物根際或植物體內定殖的能力，抑制植物病原菌和根際有害微生物及促進植物生長，從而增加作物產量。調節根際次生代謝物質產生，促進植株生長。提高根際微生物定殖能力，增強對病蟲害抗性