植物干物質含鈣一般豆科植物、甜菜、甘藍等需鈣較多，而禾谷類作物、馬鈴薯等需鈣較少。作物各器官含鈣量不一，一般地上部較多，根部較少，莖葉較多，果實、籽粒較少。在細胞中，鈣富集于細胞壁、淀粉體和核仁里。
植物中絕大部分鈣作為構成細胞壁的果膠質的結構成分。它與果膠酸結合形成果膠酸鈣唄固定，存在于相鄰兩個細胞壁之間，即中膠層處，可以增強細胞之間的粘結作用，把細胞壁連接起來。鈣又是細胞分裂所必需的成分，在細胞核分裂后，分隔兩個子細胞的細胞板就是中膠層的初期形式，它是由果膠酸鈣組成的。在缺鈣條件下，細胞板完全不能形成，子細胞也無法分隔成兩個，于是就會出現雙核細胞的現象。例如洋蔥根尖分神組織在缺鈣時就出現雙核細胞，這樣由于細胞不能分裂，生長點就會死亡。
鈣能穩定生物膜結構，它和作為膜組成成分的磷脂分子形成鈣鹽，在維持膜的結構和功能上起重要作用。在缺鈣時，大麥幼苗生長點和根細胞中原生質膜等膜系統變成片斷狀，只是根中養分大量外滲。鈣能結合在調鈣蛋白上形成復合物。該復合物能活化動植物細胞中許多酶，對細胞的代謝調節起重要作用。
缺鈣時，植株生長受阻，節間較短，因而一般較正常的矮小，而且組織柔軟。缺鈣植株頂芽、側芽、根尖等分生組織容易腐爛死亡，幼葉卷曲畸形，多缺刻狀，或從葉緣開始變黃壞死。果實生長發育不良。如甘藍、白菜和萵苣等會出現葉焦病，或稱緣腐病（因缺鈣導致硝酸在嫩葉葉片內積累，使生長點萎縮，嫩葉邊緣呈燒灼狀）。番茄、辣椒、西瓜等缺鈣易發生臍腐病，又稱頂腐病，在果實頂部產生圓形的病狀，多在幼果期開始發生，以后繼續擴展。蘋果易患苦痘病，又稱苦陷病，先在果皮下呈現褐斑，以后斑點在果皮上露出，果實上病部微凹，味苦；或患水心病，病狀出現于果心，呈水漬半透明狀，味清甜，山梨糖醇增加，易腐爛。在豆科作物中，大粒種子如蠶豆、花生對缺鈣較敏感，使胚珠敗育、種子發育不良，致使空粒或秕粒增加。
由于果實的蒸騰量較小，缺鈣時較易在果實中出現癥狀。鈣營養充足時，能降低果實的呼吸作用，增加果實硬度，使果實內臟，減少腐爛，又能提高維生素C的含量。
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